Dentro das linhas de atuação do CTI são identificadas determinadas áreas, tidas como estratégicas para o cumprimento da missão da entidade, qual seja a de contribuir para que os povos indígenas e suas comunidades assumam o controle efetivo de toda e qualquer intervenção em seus territórios, esclarecendo-lhes sobre o papel do Estado na proteção e garantia de seus direitos constitucionais.

As áreas estratégicas envolvem a participação efetiva em Fóruns e Redes com atuação política decisiva no direcionamento das políticas públicas que afetam direitos e interesses dos povos indígenas, parcerias com setores-chave do movimento indígena, com organismos governamentais e com setores da sociedade civil organizada.

Atualmente são quatro as ações estratégicas do CTI: